作為對外開放、去中心化的系統，公有鏈技術具有巨大價值的同時，從不同的立場與角度觀察，其也存在一些與生俱來、無法克服的弊端： 1.單筆交易效率較低。公有鏈由于每筆交易都需要向全網廣播，所有節點均參與記賬，參與者越多，程序越復雜，耗時越長。以比特幣為例，當有新的交易請求出現，系統在全球范圍內自動按一定概率隨機選擇一個記賬人，讓其驗證這筆交易并記賬，然后把更新的賬本“廣播”給其他記賬人。單筆交易耗時大約十分鐘左右，所有節點同步數據則需要更多的時間。公有鏈無論應用到何種場景，其“點對點”、“分布式存儲”的特性都會存在著交易耗時過長的問題。 2.消耗大量能源。因為每筆交易需要整個系統的所有節點參與，這要許多電腦終端進行大量的計算才可以完成，這勢必會消耗大量的電能。比特幣挖礦就是一項耗電量巨大的公有鏈交易。據統計，2017年11月，比特幣挖礦消耗的電力超過159個國家，其中包括愛爾蘭和非洲大多數國家。截至2018年3月，該數字已變為173，這意味著如果把比特幣挖礦活動視為一個國家的話，它將成為世界上排第47位的電力消費國（略低于科威特，但超過希臘）。[11] 3.商業應用較為困難。商業活動的目的是追逐經濟利益，一般依賴公司這樣的經濟組織通過資源交換的利差實現經營目的。公有鏈并無一個中心化的機構，其激勵機制是對某個節點工作量提供證明，并不能實現參與者的商業目的。比如比特幣挖礦取得一定數量的比特幣，是對其工作的獎勵，并不是該用戶通過交換而取得收益。在二級市場買賣比特幣獲取的收益，并不是比特幣區塊鏈本身產生的收益。這使得公有鏈很難找到合適的商業應用場景。而且，基于工作量證明機制的挖礦行為還造成了大量的資源浪費，達成共識所需要的周期也較長，因此該機制并不適合商業應用。[12]這種依靠消耗大量能源完成區塊鏈共識機制的模式，被認為是不可持續的。[13] 4.難以被監管。公有鏈去中心化的特點，與無政府主義契合，天然排斥監管。作為公有鏈的最初應用的比特幣，不是由任何國家或地區政府發行的，并無政府信用為其背書，但仍然在全世界受到許多人歡迎和追捧，一方面是因為其存在一定的利用價值，另一方面也說明很多人信奉去國家、去政府的觀念。早在20世紀70年代，哈耶克就提出貨幣不應該被政府所壟斷，每個人、組織都有權發行貨幣，參與貨幣市場的競爭。[14]該思想與比特幣產生之間的因果關系不得而知，但其區塊鏈技術的發展影響深遠。公有鏈的用戶通過互聯網連接，可能分散在世界任何一個角落，某一國或地區的政府無法對全網進行監管。 | 
